InDesignの各バージョンとも、利用する上でいまのところとくに問題は出ていません。

Macintosh版のHatsuonKigoSHBは、入力方法がやや特殊なため覚えるのがたいへんかもしれませんが、InDesignには独自の字形パレットがありますので、そちらを利用していただければより楽に入力することができます。